Інфекційно-діагностичне відділення розраховано на 40 ліжок, з яких 35 інфекційних, 5 дерматологічних. У відділенні надається допомога дітям області віком від 0 до 18 років з інфекційними захворюваннями, у тому числі ВІЛ-інфікованим та хворим на СНІД- дітям.
Відділення забезпечено централізованим постачанням кисню з використанням сучасних технологій.
Структура відділення має систему боксів з окремим санвузлом, що дозволяє провести ізоляцію хворих з різною інфекційною патологією.